TBro

TBro ist ein browserbasiertes Tool um Transkriptome zu analysieren. Dabei ist er insbesondere auch in der Lage de novo Transkriptome (also solche ohne Referenzgenom) zu handhaben. TBro wurde unter anderem genutzt um das Transkriptom der Venus Fliegenfalle zu untersuchen.

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AliTV

Eine Plattform zur intereaktiven Visualisierung von Alignments ganzer Genome. Hier ist ein Beispiel mit sieben Chloroplasten Genomen.

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bcgTree

Ein Werkzeug um automatisiert die Phylogenie von Bakterien zu rekonstruieren. Dabei werden sogenannte “single-copy core genes”, also Gene die in fast allen Bakterien genau einmal vorkommen, verwendet.

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biojs-io-biom

Eine JavaScript Bibliothek zum Umgang mit Daten im Biological Observation Matrix (BIOM) Format.

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